В 1672 г. Ньютон опубликовал в Philosophical Transactions описание классических опытов с призмами и теорию цвета. Статья вызвала возражения и многочисленные нападки, их возглавил Роберт Гук, сторонник волновой теории света. Непонимание коллег вызвало у Ньютона депрессию и тревогу.
Ньютон так же был религиозным человеком. Он выучил древнееврейский, чтобы изучать тексты Ветхого Завета, и сделал больше 30 переводов текста Библии. Реконструировал макет храма Соломона и вычислил его параметры — считая, что схема, по которой построен храм, символизирует устройство Вселенной; увлекшись прошлым, он по солнцестояниям рассчитал время экспедиции аргонавтов.
В 1686 году первый том «Математических начал натуральной философии» вышел в свет. Это было новое слово в науке, образец для подражания. Больше никакой туманной метафизики: все математические расчеты физических явлений были строги и верны. Это была новая физика и новая математика.
«Если я и видел дальше прочих, так это потому, что стоял на плечах гигантов»